Nel gioco vestirai i panni di Adam Jensen, un ex membro della SWAT, scelto per proteggere i segreti di una delle società biotecnologiche più sperimentali degli Stati Uniti. Quando una squadra dei servizi segreti fa irruzione nel complesso, uccidendo gli scienziati che avresti dovuto proteggere, tutto ciò che credevi di conoscere sul tuo lavoro cambia.
Dopo essere rimasto gravemente ferito durante l'attacco, non hai altra scelta che farti innestare dei potenziamenti meccanici prima di metterti in viaggio per il mondo alla ricerca di indizi sull'accaduto, senza mai sapere di chi poterti fidare. In un'epoca nella quale i progressi della scienza stanno trasformando atleti, soldati e spie in esseri superdotati, c'è chi trama nell'ombra per fare in modo che l'evoluzione della specie umana segua un cammino già tracciato.
A te il compito di scoprire dove porta questo cammino, il cui percorso verrà influenzato dalle decisioni che prenderai e dalle scelte che farai.
Un futuro prossimo ricco di contraddizioni. Scopri un'era caratterizzata da un enorme progresso tecnologico, ma anche da disordini e cospirazioni. I potenziamenti meccanici del corpo umano hanno diviso la società in due: chi ha accesso agli impianti e chi non se li può permettere. Nel frattempo, forze opposte cospirano nell'ombra per controllare il destino dell'umanità: una rivoluzione umana è in arrivo.